Berbeda dengan Klinik Satelit UI Makara yang merupakan fasilitas kesehatan tingkat pertama (layanan dasar), RSUI berfungsi sebagai fasilitas kesehatan rujukan tingkat lanjut (FKRTL).
Lokasi: Berada terpusat di dalam gedung RSUI yang berlokasi di area Kampus UI Depok.
Layanan Spesialistik:Menyediakan puluhan poliklinik khusus yang didukung oleh dokter ahli spesialis dan subspesialis. Beberapa di antaranya meliputi Klinik Anak, Klinik Jantung dan Pembuluh Darah, Klinik Ortopedi & Traumatologi, hingga Klinik Saraf.
Klinik Anggrek Eksekutif:RSUI juga memiliki layanan klinik eksekutif bernama Klinik Anggrek.Klinik ini mengutamakan kenyamanan, efisiensi, serta suasana yang lebih privat bagi pasien umum dan pemegang asuransi komersial.
Sistem Rujukan BPJS: Sebagai Rumah Sakit Pendidikan tipe A, poliklinik RSUI menerima pasien BPJS yang membutuhkan penanganan lebih lanjut hasil rujukan dari faskes tingkat pertama (termasuk rujukan dari Klinik Satelit Makara).