Program ini ditujukan untuk siswa yang telah lulus dari program sarjana dan ingin melanjutkan studi ke tingkat yang lebih tinggi dalam bidang tertentu. Program Spesialis ini memiliki durasi 1-2 tahun dengan serangkaian mata kuliah yang lebih spesifik dan komprehensif dan mencakup penelitian atau proyek akhir yang harus dilakukan oleh mahasiswa sebagai persyaratan untuk menyelesaikan program. Jalur masuk program ini adalah melalui SIMAK UI untuk program Pascasarjana.
Skema biaya pendidikan Spesialis UI:
| Fakultas | Program Studi | Jenjang |
|---|---|---|
| Kedokteran | Anestesiologi dan Terapi Intensif | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Ilmu Bedah | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Ilmu Penyakit Dalam | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Ilmu Kesehatan Anak | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Obstetri dan Ginekologi | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Neurologi | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Ilmu Kedokteran Jiwa | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Ilmu Kesehatan Mata | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Dermatologi dan Venereologi | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Ilmu Kesehatan Telinga Hidung Tenggorok, Bedah Kepala Leher | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Ilmu Penyakit Jantung dan Pembuluh Darah | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Pulmonologi dan Kedokteran Respirasi | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Radiologi | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Kedokteran Forensik dan Studi Medikolegal | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Patologi Anatomik | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Patologi Klinik | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Orthopaedi dan Traumatologi | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Urologi | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Ilmu Bedah Saraf | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Ilmu Kedokteran Fisik dan Rehabilitasi | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Ilmu Bedah Plastik Rekonstruksi dan Estetik | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Ilmu Kedokteran Olah Raga | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Mikrobiologi Klinik | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Farmakologi Klinik | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Kedokteran Okupasi | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Bedah Toraks, Kardiak dan Vaskular | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Onkologi Radiasi | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Kedokteran Penerbangan | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Ilmu Gizi Klinik | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Parasitologi Klinik | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Akupunktur Medik | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Kedokteran Keluarga Layanan Primer | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Pendidikan Dokter Spesialis Kedokteran Emergensi | Spesialis 1 |
| Kedokteran Gigi | Bedah Mulut dan Maksilofasial | Spesialis 1 |
| Kedokteran Gigi | Kedokteran Gigi Anak | Spesialis 1 |
| Kedokteran Gigi | Ilmu Konservasi Gigi | Spesialis 1 |
| Kedokteran Gigi | Ilmu Penyakit Mulut | Spesialis 1 |
| Kedokteran Gigi | Ortodonsia | Spesialis 1 |
| Kedokteran Gigi | Periodonsia | Spesialis 1 |
| Kedokteran Gigi | Prostodonsia | Spesialis 1 |
| Kedokteran Gigi | Radiologi Kedokteran Gigi | Spesialis 1 |
| Kedokteran Gigi | Odontologi Forensik | Spesialis 1 |
| Ilmu Keperawatan | Spesialis Keperawatan Komunitas | Spesialis 1 |
| Ilmu Keperawatan | Spesialis Keperawatan Maternitas | Spesialis 1 |
| Ilmu Keperawatan | Spesialis Keperawatan Medikal Bedah | Spesialis 1 |
| Ilmu Keperawatan | Spesialis Keperawatan Jiwa | Spesialis 1 |
| Ilmu Keperawatan | Spesialis Keperawatan Anak | Spesialis 1 |
| Ilmu Keperawatan | Spesialis Keperawatan Onkologi | Spesialis 1 |
| Kedokteran | Ilmu Penyakit Dalam | Spesialis 2 |
| Kedokteran | Ilmu Kesehatan Anak | Spesialis 2 |
| Kedokteran | Ilmu Bedah | Spesialis 2 |
| Kedokteran | Obstetri dan Ginekologi | Spesialis 2 |
| Kedokteran | Kedokteran Jiwa | Spesialis 2 |
| Kedokteran | Anestesiologi dan Terapi Intensif | Spesialis 2 |
| Kedokteran | Orthopaedi dan Traumatologi | Spesialis 2 |
| Kedokteran | Urologi | Spesialis 2 |
| Kedokteran | Jantung dan Pembuluh Darah | Spesialis 2 |
| Kedokteran | Ilmu Kesehatan Mata | Spesialis 2 |
| Kedokteran | Dermatologi Venereologi dan Estetika | Spesialis 2 |